军队主要由四部分构成：蒙古军，由蒙古人包括部 分色目人组成的部队;探马赤军,初指从蒙古诸部抽取精 锐组成的前锋、重役或远戍部队，后来也有色目人、汉 人等加入；汉军，即由原金朝地区的汉人和部分女真人、 契丹人组成的部队，还包括早期改编的南宋降军；新附 军,即灭南宋前后改编的原宋军。此外,侍卫亲军中还有 不少按族属组编的色目人部队。军队按十进制编制，分 为万户府(统兵3000～7000人)、千户所（统兵300～700 人）、百户所、牌子(10户)等4级,分由万户、千户、百 户、牌子头统领。非蒙古军的万户府、千户所又置“达鲁花赤”，是为监军官，专由蒙古或色目贵族担任。万 户府上设都万户府、大都督府等，侍卫亲军在千户所上设指挥使司。
　　蒙古军（包括色目人部队）主要是骑兵。汉军、新附军大多为步军，也配有部分骑兵。水军编有水军万户府、水军千户所等。炮军由炮手和制炮工匠组成，编有 炮手万户府、炮手千户所，设有炮手总管等。一部分侍 卫亲军中，还专置弩军千户所，管领禁卫军中的弓箭手。
　　军队依承担任务的不同，区分为宿卫和镇戍两大系 统。宿卫又分为皇帝直辖的“怯薛”军和由枢密院统领 的侍卫亲军，平时主要护卫宫廷，守卫京畿，战时也出 京征伐;镇戍诸军,屯戍于全国冲要地区。北方是蒙古军、 探马赤军的重点戍防地区；淮河以南主要由汉军、新附 军屯戍，并配置部分蒙古军和探马赤军。边境地区由分封或出镇其地的蒙古宗王所部和土著部族军配合镇守。
元朝初期的水军
蒙古人不熟悉水战，成吉思汗时，蒙古国无水军可言。太宗 四年(1232年＞，聚众坚守信安的张进(霸州保定人)降蒙。因为 “信安城四面阻水”，所以张氏属下多为水军。张进降附后，蒙古 军开始有了水军。太宗六年(1234年)，张进被金将国用安袭杀， 窝阔台命其子荣实继续领军，授职征行水军干户。太宗九年(1237 年)，张荣实改任雄州、保定、新城长官，十二年(1240年)，“复 命统领水军”，又以易州定兴人解诚为水军万户。当时蒙古军队 抄略宋境。经常在江河湖汉区域内作战，水军日益受到重视，不 少汉军万户下部有了水军。到忽必烈即位前，散在各万户的水军 有：河阴县达鲁花赤胡玉、干户王端臣军704人；八柳树干户斡 来军361入；孟州庞抄儿赤、张信军190人；滨涂州海口总把张 山军100人；沧州海口达鲁花赤塔刺海军100人；陀州盂春军55 人；霸州石抹纮查刺军195人。
由于水军人数比较少，只能应付在江河中行舟运送军队和粮 钢，没有能力进行真正的水战，消灭敌方水军。蒙古军队当时很 少制造战船。太宗时与宋朝发生的几次水上战斗，参战者并不是 水军，使用的也只是“巨筏”、“革舟”和“木筏”。至于制造浮 桥或架设桥梁，原来就是各军中的炮水手和工匠操办，水军所起的作用不大。