1998年10月26日中午，秘鲁和厄瓜多尔在巴西外交部正式签署了两国“全面、持久和平协定”、“贸易及航运协议”等4项文件，从而通过谈判结束了100多年来两国边界领土争端。秘鲁总统藤森和厄瓜多尔总统马瓦德还签署了“巴西利亚协议”。

巴西、阿根廷、智利、玻利维亚、哥伦比亚5国总统、西班牙国王卡洛斯以及美国总统特使、罗马教皇代表和500多位来自拉美各国的代表出席了签字仪式。

新的和平协定确立了秘厄两国边界的划分，厄瓜多尔将在秘鲁边境内拥有一平方公里的管辖区和使用亚马孙河航运通道的权利。协定为两国走向持久的和平与广泛的经济合作创造了条件。

秘鲁和厄瓜多尔有着1000多公里的共同边界，但是两国至今在78公里长的边界归属问题上存在着争端，导致两国关系经常出现磨擦，甚至在1941年、1981年和1995年爆发了3次军事冲突。1942年，阿根廷、巴西、智利和美国作为调停国，促使秘厄两国在里约热内卢签署了两国边界议定书。此后，厄瓜多尔声称此项议定书是在外来压力下制定的，并在划定边界时发现有“地理上的错误”而拒绝予以执行。1995年1月，两国又在有争议的边境地区发生军事冲突。巴西、阿根廷、智利和美国作为议定书保证国进行和平斡旋，促使两国于1995年2月宣布了停火声明，并开始新一轮的边界谈判。1998年，秘厄两国首脑6次应邀到巴西利亚，在巴西总统卡多佐的调解下进行直接会谈，并根据议定书保证国提出的建议达成谅解，从而为结束两国长期的边境冲突、实现和平与合作迈出决定性的一步。