1998年3月，朱榕基总理在新闻发布会上将本届政府要干的几件事情概括为：“一个确保、三个到位、五项改革”。其中医疗制度改革是“五项改革”的第四项。

即将进行的医疗制度改革，实行医院和药房收入分开管理、分别核算的新机制。11月26日至27日，全国城镇职工医疗保险制度改革工作会议在京召开，国务院副总理李岚清说，要实行医药分开核算、分别管理制度，对“一人看病，全家吃药”要采取措施。

医药要分家了，尽管许多医院感到了一种从未有过的危机，但是对于广大国人来说，这是一条令人欢欣鼓舞的好消息。近10年来，人们的工资上扬了10一20倍，可是医药费却上涨了近100一200倍。20年前在医院生一个孩子收费只不过十几元，现在却达一千到四五千元！实际情况是，中国人的医疗费是世界上最昂贵的。之所以造成这种局面，其中医、药不分家就难逃其咎。许多医生滥开贵药、好药，甚至以物代药，也不管病人能否接受。今年在南京市玄武区公安局查处的“王巧云8万元医药费诈骗案”中，从几家医院开出的处方清单上可以看到：板鸭、皮蛋、香肚、瓜子、快餐面（100箱）、西洋参（3000克）、电饭煲、浴霸等等，应有尽有。

在医药分开这一重大改革还没有正式开展前，许多医院已经急病人之所急，实施了改革。1998年7月1日，镇江市决定在市区两级部分医院开始实施药品采购申报试点，并计划组建药品供应管理中心。