太平天国的书籍，特别是作为宣传教育用的书籍，在癸好三年以后的版本有了修改。在癸好三年以前的版本，保存有浓厚的儒家思想，与上帝教义抵触的地方还多，到了癸好三年以一的刻本把它删掉，以求合於一神教的上帝教义〔二〕。

　　太平诏书是太平天国的纲领性文件，妆刻本与改正本不同的地方有三项：第一，初刻本所引孔、孟的学说，诗、书的文句，改正本或全删去，或称古语。原道醒世训引礼运「孔丘曰，大道之行也」一节共一百三十四字，改正本删去；又引易经同人卦也删去。原道觉世训引中庸、诗、书文三句都删去。又引孟子、诗经改正本虽同有，但改作「古语云」。他如原道救世歌「贤否俱循内则篇」，改正本作「贤否俱宜侍养虔」；「盍歌麟趾咏振振」，改正本作「不犯天法得超升」；「孝经当明」,改正本作「孝道当明」；「蓼莪诗句读」,改正本作「孝顺条当守」；就是经史二字，改正本也避免不用，而代以「前代」二字。第二，初刻本所引古事，凡为儒家所常称道而不合於上帝教义的，改正本都删去。原道救世歌第二不正忤父母节有「历山号泣天为动，乌为耘只象为耕，尊为天子富四海，孝德感天夫豈轻」四句，改正本删去。第三不正行杀害节有「是以先代不嗜杀，德合天心天眼开，宠绥四方惟克相，故能一统受天培，夏禹泣罪文献洛，天应人归无可猜」六句，改正本删去。第三，初刻本由古道今或以今溯古的，改正本不作上帝，则作天王自己。原道救世歌「自古君师无异任，只将正道觉斯民，自古善政无异德，只将正道淑其身」，两「自古」改正本上句作「天命」，下句作「天生」；「古来善正修天爵，富贵浮云未足奇」，「古来」改正本作「天生」；「请观桀、纣君天下，铁统江山为酒亡」，改正本作「天父上帝最恶酒，切莫鬼迷惹灭亡」。原道醒世训「王者不却众庶，故能成其德」，改正本作「上帝广生众民，故能大其德」。这些都是改作上帝的。原道救世歌「过而能改方无过，古人所以诲谆谆」，改正本下句作「予今苦口诲谆谆」，这却是改作天王自己说的。这三点不同，都显著的表示出太平天国书籍改正极力避免牵引儒家以定一尊於独一真神的上帝教。

　　又如天条书是太平一国的信仰、行动最重要的一部文件，初刻本在序言中「方顺孝得父母乎」下有商汤、周文事一段，「又有妄说拜皇上帝是从番」下，有中国有史鉴可考一大段，援引儒家所常称道的故事，博徵儒家的言论；在规定的丧礼方面，虽不准做佛事，但「大殓、成服、还山」等做法，还保存着中国的旧礼俗。到了改正本，不但是把初刻本所引儒家故事及它的言论尽删去，而且，又另制定了一种新丧礼，以「死」为「升天」，乃「头顶好事，宜欢不宜哭」，把「大殓、成服、还山」与下柩时喝唱等做法，一律废除，即棺柩也不许用，完全改变了中国的旧丧礼。

　　太平天国经籍初则援引儒家经典，到建都天京后则把它删掉，这原是自然的发展。因为天王借基督教来发动革命，人们指为「从番」，所以他就援引儒家经典来证明中国自盘古至夏、商、周三代都敬拜上帝，以排除阻力。到建都天京后，草创渐定，「万样更新」，已再没有「从番」的顾忌了，而为求定一尊於独一真神唯上帝，却必须把以前所援引的儒家经典删掉，并成立删书衙，把四书、五经中凡与独一真神的上帝教思想有抵触的都加以删改。太平天国不仅对儒家书籍如此，就是对於所宣称崇奉的旧约、新约也加以删改，而在一些着重地方，并经天王加以批解，牵引经文，为自己的政权作凭据。这种把古代称为经典的书籍中与自己的信仰抵触的地方加以删改，而对可以利用的地方则加以牵引的做法，表明太平天国删书的目的是为当前的革命斗争服务。